Vous avez un parcours solide en bioinformatique, une expertise confirmée dans le traitement et l’analyse de données protéomiques, et souhaitez intégrer une structure dynamique au cœur de l’innovation en Life Sciences ? Rejoignez-nous !

Poste basé à Lyon (possibilité de télétravail).

Vos Missions:

• Récupération et vérification de génome ou protéome en identifiant et caractérisant les gènes d'intérêt et leurs fonctions biologiques notamment en lien avec l’identification d’HCP (Host Cell Protein).

• Migration, maintenance et modernisation des infrastructures de données (notamment les bases de données Mascot).

• Support dans la réalisation et l’automatisation d’analyse de données de spectrométrie de masse.

• Support pour faciliter la génération de fragments d’anticorps (FAb) et la sélection de candidats.

• Interface technique privilégiée avec les autres départements au sein du laboratoire pour les différents projets tout en facilitant le partage des résultats entre les équipes.

• Mise en place et gestion d’un espace dédié des informations en liens avec les bioinformaticiens du département des Sciences Analytiques.

• Assurer une veille technologique sur les nouvelles approches et outils bioinformatiques.

Environnement Techniques et Applications

• Logiciels de détection et quantification des spectres peptidiques (MASCOT, Skyline, Proteome Discoverer, PEAKS)

• Outils d’analyse de séquence (Ugene, CLCGenomicsWorkbench, Geneious)

• Manipulation de séquences (Seqkit, MMseqs, BLAST) et d’alignement multiple de séquences (mafft, clustal)

• Visualisation de structures 3D (PyMOL, Chimera/ChimeraX)

• Outils d’identification d’épitopes et paratopes (SCALOP, Discotope, FreeSASA, ElliPro)

• Connaissances de bases de données spécialisées (UniProt, PDBbind, PDB, OAS, SAbDab, GISAID, IEDB)

• Maîtrise des langages R ou Python pour l'analyse de données.

Profil recherché 

• Formation : Master 2 ou Doctorat en bioinformatique, biologie computationnelle, data science appliquée à la santé ou équivalent.

• Expérience : Minimum 2 ans en analyse de données protéomiques ou en tant que bioinformaticien/ne en environnement industriel ou académique.

• Maîtrise des langages de programmation : Python, R (avec une expérience pratique de packages bioinformatiques tels que Bioconductor, Pandas, SciPy).

• Connaissance des environnements Linux/Unix et de l’utilisation de plateformes HPC / cloud (AWS, Azure, GCP) appréciée.

• Expérience sur l’analyse de données issues du séquençage haut débit (NGS) et la gestion de grands volumes de données biologiques.

• Capacité à communiquer efficacement dans un environnement multidisciplinaire, pédagogie et esprit d’équipe.

• Anglais professionnel indispensable (écrit et oral).

Pourquoi rejoindre IVIDATA Life Sciences ?

Chez IVIDATA Life Sciences, nous plaçons l’expertise en bioinformatique et data science au cœur de nos actions.
Au sein d’une communauté dynamique de plus de 160 consultants et consultantes, vous interviendrez sur l’ensemble du cycle de vie des projets innovants pour les grands acteurs des secteurs pharmaceutique, biotechnologique, dispositifs médicaux, cosmétique ou nutrition.
Notre environnement stimulant vous permettra de développer vos compétences, de participer à des projets d’envergure internationale et d’avoir un impact direct sur l’innovation en santé.
Vous bénéficierez d’une réelle autonomie, d’un accompagnement continu, et d’opportunités d’évolution passionnantes dans le domaine de la bioinformatique appliquée aux Life Sciences.